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      生物信息學服務
      群落組成分析
      【添加時間:2016-09-12 09:28:24】【來源:】【作者:dggadmin】
           群落組成分析是基于OTU豐度表及其微生物分類(門、綱、目、科、屬)所做的分析,主要包含以下幾個方面:

      1. 樣本群落組成圖

          根據分類學分析結果,可以得知多個樣品在各分類水平上的物種組成比例情況,反映樣品在不同分類學水平上的群落結構。根據具體情況可選擇合適的作圖類型(柱狀圖、散點/折線圖、餅圖等):
      \

      圖1 樣本群落組成圖

      2. 樣品OTU 分布Venn 圖

           用于統計多個樣品中共有或獨有的OTU數目,可以比較直觀地表現各組樣品之間的OTU 組成相似程度。
      圖3.2中各個數字代表了某組樣品獨有或幾組樣品共有的OTU 數量,對分析要求:樣品分組至少2個,最多5 個。


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      圖2 樣品OTU 分布Venn圖

      3. 熱圖 (Heatmap)

           熱圖用顏色變化來反映微生物群落(或功能)的豐度信息,它可以直觀地將數值大小用顏色深淺表示出來。也可以將高豐度和低豐度的物種分塊聚集,通過顏色梯度及相似程度來反映多個樣品在各分類水平上群落組成的相似性和差異性。
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      圖3 高豐度OTU的熱圖
          左邊是微生物分類,右邊是OTU編號,下邊文字是樣品名稱,顏色反映OTU在樣品中的相對豐度。



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